Paolo Boccacci

La mia attività di ricerca e supporto tecnico sono principalmente focalizzate sulla vite (Vitis vinifera L.) e si sviluppano su quattro grandi linee:

Interazione genotipo-ambiente. Il sequenziamento dell’intero genoma di tre cloni di ‘Nebbiolo’ rappresenta il punto di partenza per lo studio delle interazioni tra il genotipo e le condizioni pedoclimatiche di coltivazione, che contribuiscono a definire al terroir vitivinicolo. La ricerca è svolta con un approccio agronomico, trascrittomico (RNA-seq) ed epigenomico (BS-seq), al fine di mettere in relazione il comportamento genico dei tre cloni in quattro diversi ambienti colturali. In parallelo, l’interazione genotipo-ambiente è anche studiata in vitro sui vitigni ‘Sangiovese’ e ‘Cabernet Sauvignon’, al fine di caratterizzare la plasticità dell’embriogenesi somatica e studiare i meccanismi molecolari alla base di questo processo (studio di geni WOX in piante di Arabidopsis geneticamente trasformate).

Interazione pianta-patogeno. Lo studio dell’interazione e delle risposte della pianta agli stress biotici ed abiotici viene svolto attraverso analisi trascrittomiche (microarray, RNA-seq e qRT-PCR), di small RNAs (miRNAs e vsiRNA) ed epigenomiche, con particolare attenzione ai virus GRSPaV e GFkV ed al fitoplasma responsabile della Flavescenza dorata (fitoplasmi). Inoltre si stanno approfondendo le complesse interazioni tra virus-pianta-stress idrico.

Caratterizzazione genetico-sanitaria di cloni. Identificazione di marcatori molecolari SNP (single nucleotide polymorphism), al fine di sviluppare tecniche di genotyping con metodo Taqman al fine di discriminare i cloni. Diagnosi dei principali virus e fitoplasmi con tecniche sierologiche e molecolari.

Biodiversità genetica. Caratterizzazione genetica, mediante l’impiego di marcatori molecolari microsatelliti o SSR (simple sequence repeat) di vitigni piemontesi, italiani ed internazionali, ai fini di: fingerprinting, identificazione di sinonimie ed omonimie, studi di parentela ed analisi della struttura genetica del germoplasma coltivato e selvatico, in un’ottica di recupero e salvaguardia della biodiversità viticola.

A livello amministrativo collaboro in qualità di Responsabile Unico del Procedimento (RUP) e come Referente per la sicurezza dell’Unità di Grugliasco.

Durante il Dottorato di Ricerca, e nel successivo periodo post-doc presso l’Università degli Studi di Torino, ho coordinato e svolto ricerche di caratterizzazione genetica del germoplasma di nocciolo (Corylus avellana L.), mediante marcatori molecolari microsatelliti, riguardanti: l’identificazione varietale, il recupero e la salvaguardia della biodiversità, la genetica di popolazioni,origine e diffusione delle cultivar, realizzazione di due progenie di nocciolo ai fini del mappaggio genetico di QTL (quantitative trait loci) associati a caratteri di resistenza, agronomici e merceologici.

Progetti

Articoli in rivista e capitoli di libri dal 2008

  • 2018 - Dissecting interplays between Vitis vinifera L. and grapevine virus B (GVB) under field conditions - Chitarra W., Cuozzo D., Ferrandino A., Secchi F., Palmano S., Perrone I., Boccacci P., Pagliarani C., Gribaudo I., Mannini F., Gambino G. - Molecular Plant Pathology , 19: 2651-2666
  • 2018 - miRVIT: A novel miRNA database and its application to uncover vitis responses to flavescence dorée infection - Chitarra W., Pagliarani C., Abbà S., Boccacci P., Birello G., Rossi M., Palmano S., Marzachì C., Perrone I., Gambino G. - Frontiers in plant science, volume 9
  • 2017 - Grapevine Grafting: Scion Transcript Profiling and Defense-Related Metabolites Induced by Rootstocks - Chitarra W., Perrone I., Avanzato C.G., Minio A., Boccacci P., Santini D., Gilardi G., Siciliano I., Gullino M.L., Delledonne M., Mannini F., Gambino G. - Frontiers in plant science, 8: 654
  • 2017 - Ozone Improves the Aromatic Fingerprint of White Grapes - Rio Segade S., Vilanova M., Giacosa S., Perrone I., Chitarra W., Pollon M., Torchio F., Boccacci P., Gambino G., Gerbi V., Rolle L. - Scientific reports, volume 7
  • 2017 - Whole-genome sequencing and SNV genotyping of ‘Nebbiolo’ (Vitis vinifera L.) clones - Gambino G., Dal Molin A., Boccacci P., Minio A., Chitarra W., Avanzato C.G., Tononi P., Perrone I., Raimondi S., Schneider A., Pezzotti M., Mannini F., Gribaudo I., Delledonne M. - Scientific reports, volume 7
  • 2017 - Cultivar-specific gene modulation in Vitis vinifera: Analysis of the promoters regulating the expression of WOX transcription factors - Boccacci P., Mela A., Pavez Mina C., Chitarra W., Perrone I., Gribaudo I., Gambino G. - Scientific reports, 7: 45670
  • 2016 - Grapevine-virus-environment interactions: An intriguing puzzle to solve - Perrone I., Chitarra W., Boccacci P., Gambino G. - New Phytologist ,
  • 2016 - L’analisi del DNA svela l’origine dei vitigni. Ecco come sono nati Ruché ed altri aromatici piemontesi - Schneider A., Ruffa P., Raimondi S., Boccacci P., Abbà S. - Oicce Times , 68: 25-30
  • 2016 - Identification and characterization of Vitis vinifera subsp. sylvestris populations in north-western Italy - Schneider A., Boccacci P., Ruffa P., Torello Marinoni D., Cavallo L., Festari I., Rotti G., Raimondi S. - Vitis , 54: 223-225
  • 2016 - Genetic mapping and QTL analysis in European hazelnut (Corylus avellana L.) - Beltramo C., Valentini N., Portis E., Torello Marinoni D., Boccacci P., Sandoval Prando M.A., Botta R. - Molecular Breeding , 36: 1-17
  • 2016 - Novel functional microRNAs from virus-free and infected Vitis vinifera plants under water stress - Pantaleo V., Vitali M., Boccacci P., Miozzi L., Cuozzo D., Chitarra W., Mannini F., Lovisolo C., Gambino G. - Scientific Reports (Nature Publishing Group), 6: 20167
  • 2016 - The key role of ‘Moscato bianco’ and ‘Malvasia aromatica di Parma’ in the parentage of traditional aromatic grape varieties - Ruffa P., Raimondi S., Boccacci P., Abbà S., Schneider A. - Tree Genetics & Genomes , volume 12
  • 2015 - A multidisciplinary approach to enhance the conservation and use of hazelnut Corylus avellana L. genetic resources - Bacchetta L., Rovira M., Tronci C., Aramini M., Drogoudi P., Silva A.P., Solar A., Avanzato D., Botta R., Valentini N., Boccacci P. - Genetic Resources And Crop Evolution , 62: 649-663
  • 2015 - In silico mining, characterization and cross-species transferability of EST-SSR markers for European hazelnut (Corylus avellana L.) - Boccacci P., Beltramo C, Sandoval Prando M.A., Lembo A., Sartor C., Mehlenbacher S.A., Botta R., Torello Marinoni D. - Molecular Breeding , 35: 1-14
  • 2015 - Studio per l’individuazione dei portinnesti più adatti alla coltivazione del Gaglioppo - Mannini F., Schneider A., Gambino G., Boccacci P., Santini D., Chitarra W., Perrone I. - Librandi S.p.A., Cirò M. (KR) (ITA),
  • 2014 - Investigation on clonal variants within the hazelnut (Corylus avellana L.) cultivar ‘Tonda Gentile delle Langhe’ - Valentini N., Calizzano F., Boccacci P., Botta R. - Scientia Horticulturae , 165:303-310
  • 2013 - Molecular and morphological diversity of on-farm hazelnut (Corylus avellana L.) landraces from southern Europe and their role in the origin and diffusion of cultivated germplasm - Boccacci P., Aramini M., Valentini N., Bacchetta L., Rovira M., Drogoudi P., Silva A.P., Solar A., Calizzano F., Erdoğan V., Cristofori V., Ciarmiello L.F., Contessa C., Ferreira J.J., Marra F.P., Botta R. - Tree Genetics & Genomes, 9:1465-1480
  • 2013 - Hydrogen peroxide accumulation and transcriptional changes in grapevines recovered from flavescence dorée disease - Gambino G., Boccacci P., Margaria P., Palmano S., Gribaudo I. - Phytopathology, 103:776-784
  • 2013 - Nuclear and chloroplast microsatellite markers to assess genetic diversity and evolution in hazelnut species, hybrids and cultivars - Bassil N., Boccacci P., Botta R., Postman J., Mehlenbacher S.A. - Genetic resources and crop evolution, 60:543-568
  • 2012 - Co-evolution between Grapevine rupestris stem pitting associated virus and Vitis vinifera L. leads to decreased defence responses and increased transcription of genes related to photosynthesis - Gambino G., Cuozzo D., Fasoli M., Pagliarani C., Vitali M., Boccacci P., Pezzotti M., Mannini F. - Journal of Experimental Botany, 63:5919-5933
  • 2012 - Co-evolution between Grapevine rupestris stem pitting-associated virus and Vitis vinifera L. leads to decreased defence responses and increased transcription of genes related to photosynthesis. - Gambino G., Cuozzo D., Fasoli M., Pagliarani C., Vitali M., Boccacci P., Pezzotti M., Mannini F. - JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY, 63:5919-5933
  • 2012 - Genetic traceability of Asti Spumante and Moscato d’Asti musts and wines using nuclear and chloroplast microsatellite markers - Boccacci P., Akkak A., Torello Marinoni D., Gerbi V., Schneider A. - European Food Research & Technology, 235:439-446
  • 2011 - Characterization of expression dynamics of WOX homeodomain transcription factors during somatic embryogenesis in Vitis viniferaEmbryogenesis In Vitis Vinifera. - Gambino G., Minuto M., Boccacci P., Perrone I., Vallania R., Gribaudo I. - Journal Of Experimental Botany (53988J0), 62: 1089-1101
  • 2010 - Transgene silencing in grapevines transformed with GFLV resistance genes: analysis of variable expression of transgene, siRNAs production and cytosine methylation - Gambino G., Perrone I., Carra A., Chitarra W., Boccacci P., Torello Marinoni D., Barberis M., Maghuly F., Laimer M., Gribaudo I. - Transgenic Research, 19:17-27
  • 2009 - Characterization of T-DNA insertions in transgenic grapevines obtained by Agrobacterium -mediated transformation - Gambino G., Chitarra W., Maghuly F., Laimer M., Boccacci P., Torello Marinoni D., Gribaudo I. - Molecular Breeding, 24:305-320
  • 2009 - Molecular characterization of wild grape populations from north western Italy and their genetic relationship with cultivated varieties - Schneider A., Torello Marinoni D., Raimondi S., Boccacci P., Gambino G. - Acta Horticulturae , 827:211-216