Simona Abbà

Sono ricercatrice al CNR dal 2011. Mi occupo di:

  • assemblaggio di sequenze di genomi e trascrittomi di fitoplasmi e di insetti vettori;
  • caratterizzazione dell’iflavirus EVV-1 nell’insetto vettore di fitoplasmi Euscelidius variegatus;
  • analisi in silico di miRNA in pianta
  • genotipizzazione di vite tramite SNPs

Sono interessata anche alla condivisione open access dei dati di ricerca. Con i colleghi Giancarlo Birello e Anna Perin dell’IRCrES-CNR abbiamo sviluppato una piattaforma open source chiamata “V2P2 repository” per la digitalizzazione, conservazione e l’accesso libero e senza restrizioni ai risultati e ai dati della ricerca.

Nel corso del Dottorato di Ricerca mi sono dedicata allo studio dell’interazione tra pianta e funghi micorrizici (principalmente Tuber borchii). Durante il periodo di post-dottorato, ho focalizzato la mia attenzione sulla possibilità di impiego del fungo micorrizico ericoide Oidiodendron maius nei processi di biorisanamento ambientale dall’inquinamaneto di metalli pesanti. Questi studi sono stati condotti principalmente con approcci biomolecolari e biochimici, ai quali è stato affiancato l’utilizzo di Saccharomyces cerevisiae come organismo modello per effettuare prove di mutagenesi, analisi fenotipica e studi di interazione proteina/proteina con la tecnica del doppio ibrido.

Per una lista completa delle mie pubblicazioni fare riferimento a: ORCID ID 0000-0001-9345-5407

Progetti

Articoli in rivista e capitoli di libri dal 2008

  • 2018 - Two phytoplasmas elicit different responses in the insect vector Euscelidius variegatus Kirschbaum - Galetto L., Abbà S., Rossi M., Vallino M., Pesando M., Arricau-Bouvery N., Dubrana M.-P., Chitarra W., Pegoraro M., Bosco D., Marzachì C. - Infection And Immunity , volume 86
  • 2018 - miRVIT: A novel miRNA database and its application to uncover vitis responses to flavescence dorée infection - Chitarra W., Pagliarani C., Abbà S., Boccacci P., Birello G., Rossi M., Palmano S., Marzachì C., Perrone I., Gambino G. - Frontiers in plant science, volume 9
  • 2017 - Genome sequence, prevalence and quantification of the first iflavirus identified in a phytoplasma insect vector - Abbà S., Galetto L., Vallino M., Rossi M., Turina M., Sicard A., Marzachì C. - Archives Of Virology , 162: 799–809
  • 2017 - Identification of putative effector genes and their transcripts in three strains related to ‘Candidatus Phytoplasma aurantifolia’ - Anabestani A., Izadpanah K., Abbà S., Galetto L., Ghorbani A., Palmano S., Siampour M., Veratti F., Marzachì C. - Microbiological Research , 199: 57-66
  • 2016 - Complete Genome Sequences of the Obligate Symbionts “Candidatus Sulcia muelleri” and “Ca. Nasuia deltocephalinicola” from the Pestiferous Leafhopper Macrosteles quadripunctulatus (Hemiptera: Cicadellidae). - Bennett G.M., Abbà S., Kube M., Marzachì C. - Genome Announcements, 4(1)
  • 2016 - The key role of ‘Moscato bianco’ and ‘Malvasia aromatica di Parma’ in the parentage of traditional aromatic grape varieties - Ruffa P., Raimondi S., Boccacci P., Abbà S., Schneider A. - Tree Genetics & Genomes , volume 12
  • 2016 - L’analisi del DNA svela l’origine dei vitigni. Ecco come sono nati Ruché ed altri aromatici piemontesi - Schneider A., Ruffa P., Raimondi S., Boccacci P., Abbà S. - Oicce Times , 68: 25-30
  • 2016 - RiPEIP1, a gene from the arbuscular mycorrhizal fungus Rhizophagus irregularis, is preferentially expressed in planta and may be involved in root colonization - Fiorilli V., Belmondo S., Khouja H.R., Abbà S., Faccio A., Daghino S., Lanfranco L. - Mycorrhiza , 6:609-621
  • 2015 - Shall we share? A repository for Open Research Data in agriculture and environmental sciences - Abbà S., Birello G., Vallino M., Perin A., Ghignone S., Caciagli P. - EPPO Bulletin , 45:311-316
  • 2015 - The Importance of the KR-Rich Region of the Coat Protein of Ourmia melon virus for Host Specificity, Tissue Tropism, and Interference With Antiviral Defense. - Rossi M., Vallino M., Abbà S., Ciuffo M., Balestrini R., Genre A., Turina M. - Molecular Plant-Microbe Interactions, 28:30-41
  • 2015 - A rice GRAS gene has an impact on the success of arbuscular mycorrhizal colonization - Fiorilli V., Volpe V., Zanini S., Vallino M., Abbà S., Bonfante P. - American Journal Of Plant Sciences (Print), 6:1905-1915
  • 2015 - Decreasing global transcript levels over time suggest that phytoplasma cells enter stationary phase during plant and insect colonization - Pacifico D., Galetto L., Rashidi M., Abbà S., Palmano S., Firrao G., Bosco D., Marzachì C. - Applied And Environmental Microbiology, 81:2602-2591
  • 2014 - Gene expression and role in cadmium tolerance of two PLAC8-containing proteins identified in the ericoid mycorrhizal fungus Oidiodendron maius - Di Vietro L., Daghino S., Abbà S., Perotto S. - Fungal Biology , 118:695-703
  • 2014 - OmGOGAT-disruption in the ericoid mycorrhizal fungus Oidiodendron maius induces reorganization of the N pathway and reduces tolerance to heavy-metals - Khouja H.R., Daghino S., Abbà S., Boutaraa F., Chalot M., Blaudez D., Martino E., Perotto S. - Fungal Genetics And Biology , 71:1-8
  • 2014 - RNA-Seq profile of flavescence dorée phytoplasma in grapevine - Abbà S., Galetto L., Carle P., Carrère S., Delledonne M., Foissac X., Palmano S., Veratti F., Marzachì C. - BMC Genomics , 15:1088
  • 2013 - Novel aspects of grapevine response to phytoplasma infection investigated by a proteomic and phospho-proteomic approach with data integration into functional networks - Margaria, P., Abbà, S., Palmano, S. - BMC Genomics, 14:38
  • 2011 - The Perigord black truffle responds to cold temperature with an extensive reprogramming of its transcriptional activity - Zampieri E., Balestrini R., Kohler A., Abbà S., Martin F., Bonfante P. - Fungal Genetics And Biology, 48:585-591